Фамилия Бердыбекова — женская форма, а мужская, Бердыбеков, образована от составного тюркского имени Бердыбек. В её основе два компонента: «берды» (от тюркского «бер» — «дал», «дарованный») и «бек» — титул, означающий «господин», «князь», «правитель». Таким образом, имя Бердыбек буквально переводится как «данный беком» или «дарованный господином». Это типичное для тюркских народов сложение, где вторая часть — социальный статус, а первая — указание на происхождение или обстоятельство рождения.

Фамилия распространена среди народов, говорящих на тюркских языках: казахов, киргизов, татар, башкир, а также у народов Кавказа, например, у кумыков и ногайцев. Русский суффикс -ов (в женской форме -ова) указывает на принадлежность: «сын (или дочь) Бердыбека». В самой фамилии нет указания на сословие — её могли носить и потомки родоплеменной знати, и люди, получившие имя в честь уважаемого предка. Встречается написание с буквой «ё» (Бердыбёкова), но оно менее распространено и обычно отражает местное произношение.

Интересная деталь: в некоторых тюркских языках имя Бердыбек могло быть не первым, а вторым, «охранительным» именем. Ребёнку давали такое имя, чтобы подчеркнуть его ценность для рода или чтобы «обмануть» злых духов, показав, что дитя — дар высокого покровителя. Фамилия, таким образом, хранит не только семейную историю, но и отголосок древних верований.