Фамилия Беркенов — один из тех случаев, когда корень ведёт не в славянскую, а в тюркскую ономастику, и это определяет всю историю её появления. Основа здесь — Беркен, личное имя или прозвище, которое восходит к тюркскому «берк» (крепкий, сильный, надёжный) с добавлением уменьшительно-ласкательного аффикса «-ен». Получается что-то вроде «крепенький» или «силач». В русскую фамильную модель имя Беркен вошло через стандартный патронимический суффикс -ов, который в тюрко-русском пограничье работал как универсальный маркер: «сын Беркена».

Географически фамилия тяготеет к регионам, где веками шло смешение тюркских и славянских родов: Поволжье, Приуралье, юг Сибири. У татар, башкир, казахов имя Беркен (иногда в форме Биркен) фиксировалось как мужское личное имя. В русских переписных книгах XVI–XVII веков такие имена могли записывать служилым татарам, музам (перешедшим на русскую службу) или крещёным инородцам — именно они первыми получали фамилии на -ов, вписываясь в московскую бюрократию.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий с тюркским корнем, у Беркенова нет параллельных вариантов с суффиксом -ин (Беркенин). Это косвенно указывает, что основа попала в русскую среду не через прямое отчество от отца-тюрка (где работал бы -ин), а через уже готовое имя Беркен, которое записали в форму родительного падежа по русскому образцу. Такое бывало в приказных избах, когда писарь механически добавлял -ов к любому незнакомому имени.

Сословный разброс мог быть любым: от рядового казака или ямщика до мелкопоместного дворянина, получившего фамилию по деду-толмачу. Поскольку имя Беркен не было княжеским или ханским, ждать древнего боярского рода не стоит — это фамилия людей «служилых и работных», которые обживали границы Московского царства.