Фамилия Беркенова — женская форма, исходная мужская — Беркенов. Она сразу отсылает к тюркскому миру, и это главный ключ к её происхождению. Основа фамилии — личное имя Беркен, которое состоит из двух тюркских корней: «берк» (крепкий, прочный, устойчивый) и «ен» (широкий, просторный, либо же суффикс обладания). Имя Беркен можно перевести как «крепкий и широкий», «надёжный простор» или «обладающий крепостью». В кочевой культуре такие имена давали мальчикам с пожеланием физической силы, выносливости и способности выживать в степи.

Фамилия образована по стандартной русской модели патронимической фамилии: к основе Беркен добавили русский суффикс -ов. Это типично для фамилий тюркского происхождения, которые оформились у народов, вошедших в состав Российской империи, — у казахов, татар, башкир, ногайцев. Окончание -ова указывает на принадлежность к роду: буквально «дочь (или жена) Беркена».

Географически фамилия Беркенова чаще всего встречается в Казахстане, особенно в западных и северных областях, а также среди татар и башкир. В России она редка и сосредоточена в регионах, граничащих с Казахстаном, — Оренбургской, Астраханской, Саратовской областях. Это указывает на то, что предки носителей фамилии были, скорее всего, кочевниками-скотоводами, а имя Беркен не было редким в среде казахов и татар.

В отличие от многих русских фамилий, которые образованы от крестильных имён (Иван — Иванов), Беркенова не имеет христианской основы. Она сохранила доисламское тюркское имя, что говорит о глубоких родовых корнях, не затронутых арабизацией. Это важная деталь: фамилия не происходит от арабского «беркет» (благодать), как иногда ошибочно полагают. Корень «берк» в значении «крепкий» — исконно тюркский, он встречается в древнетюркских памятниках и в топонимах (например, Берке — хан Золотой Орды).

Сравнение с однокоренными фамилиями — Берков, Беркеев, Беркутов — показывает, что Беркенов стоит особняком: суффикс -ен в имени-основе встречается реже, чем -к или -у, и придаёт фамилии более архаичное звучание. Если Берков мог произойти от прозвища «берк» (крепкий) напрямую, то Беркенов — от полного имени, которое уже не было просто прозвищем, а стало личным именем в роду.