Фамилия Бескишкина — женская форма русской фамилии Бескишкин, которая, в свою очередь, представляет собой адаптированный вариант украинской фамилии Бескишка. В основе фамилии лежит прозвище, и его происхождение спорно — исследователи предлагают как минимум две версии.

Первая и наиболее прямая версия связывает прозвище Бескишка с сочетанием «без кишок». В украинском языке слово «кишка» означает то же, что и в русском. Такое прозвище могло закрепиться за человеком, у которого были проблемы с пищеварением, или, в переносном смысле, за тем, кто очень мало ел. Это объяснение лежит на поверхности и кажется наиболее вероятным.

Вторая версия отталкивается от украинского слова «кiшка» — «кошка». Согласно этой гипотезе, Бескишкой могли назвать человека, в доме которого не было кошек. Такое объяснение менее убедительно с лингвистической точки зрения: замена корня «кишк-» (от «кишка») на «кiшк-» (от «кiшка») при образовании прозвища маловероятна, так как меняется смысл слова. Однако полностью исключать её нельзя — народная этимология порой создаёт самые неожиданные прозвища.

Сама словообразовательная модель типична для украинских ироничных прозвищ, построенных по схеме «без + существительное». Примерно так же появились фамилии Безруков, Безносов, Безбородов. Прозвище Бескишка закрепилось за человеком, обладавшим какой-то заметной особенностью — скорее всего, связанной с едой или здоровьем. При переходе в русскую среду фамилия получила типичный русский суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей?» — Бескишкин, то есть сын или потомок Бескишки.

Социальный состав носителей фамилии не определён, но по модели образования она характерна для крестьянской и казацкой среды, где ироничные прозвища были обычным делом. География фамилии, судя по встречаемости, тяготеет к южнорусским и украинским регионам.

Сегодня фамилия Бескишкина — редкая. Её носители могут с уверенностью говорить, что их предок выделялся среди окружающих какой-то бытовой чертой, которую соседи подметили и закрепили в прозвище.