Фамилия Беткова — женская форма от Бетков, а в её основе лежит прозвище Бетко. О его происхождении есть несколько версий, и ни одна из них не выглядит натянутой.

Самая конкретная версия связывает прозвище с русским словом «беть». Так называли поперечную скрепу барок — бревно, которое клали с борта на борт и врубали в них, или же нижний рей, растягивающий нижние углы паруса на ладьях и шняках. Если это так, то первый Бетко жил на берегу судоходной реки или моря и занимался постройкой или оснасткой судов. В пользу этой гипотезы говорит то, что в северных и волжских говорах слово «беть» было вполне обиходным, а фамилии, образованные от названий деталей корабля или снастей, встречаются нередко.

Есть и другая версия, связанная с карачаево-балкарским языком: слово «бет» означает «лицо». В таком случае Бетко — прозвище миловидного или, возможно, обладающего заметными чертами лица человека. Эта версия возможна в районах, где русское население долго соседствовало с тюркским, но географически она менее типична для фамилии, чем первая.

Наконец, Беткова могла стать фонетическим вариантом фамилии Биткова. Звуки «и» и «е» в безударной позиции в некоторых говорах произносились сходно, а на письме это закреплялось. Исходное прозвище Битко тогда связано с глаголом «бить» — так могли прозвать храброго воина, драчуна или человека с сильным характером.

Суффикс -к- в основе Бетко указывает на уменьшительно-ласкательную форму, а фамилия на -ов/-ева — на принадлежность: «сын Бетка».