Фамилия Безбогин — редкий случай, когда фамилия прямо называет мировоззренческую позицию предка. В основе лежит прозвище Безбогий, то есть человек, не верящий в Бога, атеист. Фамилия образована по стандартной модели: к основе на -ий добавляется суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей сын?» — Безбогин.

На первый взгляд, такое прозвище кажется однозначным, но в реальной жизни XVI–XVII веков его могли дать не столько за атеизм (понятие тогда было иным), сколько за несоблюдение обрядов, пропуск церковных служб или за грубость по отношению к священнику. В крестьянской среде «безбогим» могли назвать человека, который не ставил свечи, не постился или ругался «не по-христиански». Таким образом, фамилия фиксирует не столько философское убеждение, сколько бытовое поведение, которое окружающие считали греховным.

Фамилия Безбогин — искусственного происхождения, то есть не церковная (в святцах такого имени нет) и не княжеская. Она относится к группе «идеологических» прозвищ, которые в русской ономастике встречаются редко. Аналогичные фамилии — Безверхов, Безбожников (от слова «безбожник»), Безгрешный. Но Безбогин стоит особняком: суффикс -ин характерен для северных и центральных областей России, в отличие от -ов, который преобладает на юге.

Встречается фамилия в основном в центральной России, в Поволжье и на Урале. В документах XVIII–XIX веков носители Безбогины — чаще всего государственные крестьяне и однодворцы. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что косвенно подтверждает её «низовое» происхождение.

В советское время фамилия не исчезла, хотя могла восприниматься как неудобная для атеистической пропаганды (слишком буквальное указание на безбожие). Однако носители, как правило, не меняли её, и сегодня Безбогины встречаются в разных регионах, хотя и остаются немногочисленными.