Фамилия Бидеркин ведет свое начало от прозвище Бидерка, которое восходит к украинскому слову «бiдар» - «бедняк». Следовательно, основатель рода Бидеркиных мог быть бедным человеком. Согласно другой версии, Бидеркин — русифицированная немецко-еврейская фамилия Бидер, образованная от аналогичного прозвища. Это прозвище восходит к немецкому слову bieder, которое на русский язык переводится как «честный, порядочный». В таком случае данная фамилия указывала на особенности характера предка Бидеркиных. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бидерка, со временем получил фамилию Бидеркин.