Фамилия Бикиняев — редкий случай, когда исходное слово почти не оставляет сомнений в своём значении, но зато заставляет гадать о географии. Основа здесь — тюркское «бикен» или «бикян», что в ряде языков (татарском, башкирском, казахском) означает «госпожа», «княгиня», «женщина знатного рода». Суффикс «-ев» указывает на русскую модель образования: так оформляли фамилии от тюркских имён и прозвищ в XV–XVII веках, когда служилые татары и башкиры переходили в русское подданство и получали документальные фамилии.

Скорее всего, Бикиняев — это не прозвище по профессии, а патроним от личного имени Бикен (Бикян). В тюркской ономастике такие имена давали девочкам в семьях, желавших подчеркнуть их красоту или знатность. Однако носитель фамилии — мужчина, а женское имя в основе — не редкость: по той же модели возникли, например, фамилии Зиновьев (от Зиновия) или Марьин. Возможно, предком был человек, которого в быту звали Бикен — ласково, по матери или по жене, или же он сам носил прозвище Бикен (в тюркских языках слово могло относиться и к мужчине как уважительное «князёк»).

Географически фамилия тяготеет к регионам с татарским и башкирским населением: Татарстан, Башкортостан, Оренбуржье. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении — возможно, от одного рода или села. В письменных источниках XVII–XVIII веков фамилия не зафиксирована, но это объяснимо: основная масса тюркских фамилий на «-ев» оформилась поздно, в XIX веке, при переписях и паспортизации.

Есть и другая, менее надёжная версия: от слова «бикень» — в некоторых диалектах так называли разновидность рыбы или растения. Но она не выдерживает критики: суффикс «-яев» в таком случае давал бы иное звучание (Бикенев), а не Бикиняев. Форма «-яев» характерна именно для имён на «-я» (Илья — Ильин, но Бикя — Бикиняев). Поэтому версия с личным именем Бикя (Бикян) остаётся основной.

Что касается сословной принадлежности, то носители фамилии могли быть как крестьянами (государственными или помещичьими), так и служилыми людьми — татарскими мурзами, которые после присоединения Казанского ханства несли службу в русских войсках. Точных данных по Бикиняевым нет, но в целом фамилии на «-ев» от тюркских основ редко указывают на высшую аристократию, чаще — на средние слои: ясачные крестьяне, казаки, мелкие помещики.