Фамилия Благоевач — редкий случай, когда славянская модель образования сталкивается с нетипичной для русского языка основой. Сразу бросается в глаза суффикс -евич, который в русской фамильной системе почти всегда даёт окончание -ев (Благоев), а здесь мы видим полную форму -евач. Это характерный признак фамилий, возникших в западнославянской или южнославянской среде, особенно в сербском, хорватском или словенском ареалах. В этих языках суффикс -евић/-ević (в кириллице -евић, в латинице -ević) образует отчества и фамилии со значением «сын такого-то». Русская передача через -евач — это калька с южнославянского произношения, где конечное «ћ» передаётся как «ч».

Основа фамилии — Благо- — восходит к корню «благ», то есть «добро», «хорошо», «счастье». В славянских языках это слово имеет широкий спектр значений: от «благо» (материальное или духовное добро) до «благой» (добрый, хороший). Скорее всего, прозвище Благо (или Благое) дали человеку с добрым нравом, удачливому, либо тому, кто приносил удачу. В южнославянской традиции такие прозвища часто фиксировались как личные имена (Благо, Благое, Благоя), от которых затем образовывались фамилии-отчества.

Таким образом, Благоевач буквально означает «сын Благоя» (или «потомок того, кого звали Благо»). Фамилия не имеет отношения к русскому духовенству или церковной лексике, несмотря на корень «благ». В России она практически не встречается: это типичная балканская фамилия, которая могла попасть в русский контекст через миграцию, браки или исторические связи (например, переселение сербов в Российскую империю в XVIII–XIX веках).

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то в русском языке аналогом была бы фамилия Благов (от прозвища Благой), но Благоевач сохранила более архаичную и «иностранную» для русского уха форму. Носитель такой фамилии почти наверняка имеет предков из Сербии, Черногории, Боснии или Хорватии, где фамилии на -евич/-евић — одни из самых распространённых.