Фамилия Бобошина — уральская по месту бытования, но её корни уходят в северные земли, в частности в Чердынский уезд. В основе фамилии лежит прозвище Бобоша. Самая прямая версия связывает его с глаголом «бобочить» — говорить без толку, болтать. Так могли прозвать очень общительного человека, балагура, который много говорит, но не по делу. Таким образом, прозвище Бобоша указывает на особенность характера и поведения родоначальника.

Существует и другая версия, менее правдоподобная: от слова «боб» — зерно стручковых растений. Согласно ей, Бобошей могли назвать человека, занятого выращиванием или продажей бобов, гороха, фасоли. Тогда прозвище относилось бы к «профессиональным» именованиям, указывающим на род занятий предка. Однако основная, «говорливая» версия выглядит убедительнее, так как глагол «бобочить» жив в народной речи, а связь с бобами — лишь косвенная звуковая ассоциация.

Исторические документы сохранили несколько ранних упоминаний. Алексей Федорович Бобоша жил в первой половине XV века, и именно ему принадлежало селение Бобошино в бывшем Переяславском уезде. В 1564 году в Обонежье упоминается крестьянин Бобоша, а в 1624 году — в Курмыше. В 1579 году в Вологде зафиксирован «чердынец Иванко Бобошина» — форма записи уже фамильная, через суффикс принадлежности -ин.

На Средний Урал фамилия пришла в XVII веке. Крестьянин Тимофей Семенович Бобошина, живший в деревне Зайковой (Ирбитская слобода), был родом из деревни Бобошиной в Покчинской волости Чердынского уезда. Он переселился оттуда в 1642 году. Эта миграционная цепочка — из Чердыни на Урал — типична для того времени и объясняет, почему фамилия закрепилась именно как уральская. Форма Бобошина (а не Бобошин) — это старая, архаичная модель: фамилия на -ина в именительном падеже могла указывать на принадлежность к роду или на происхождение из конкретного места. В современном употреблении фамилия склоняется по общим правилам: Бобошина (женская форма) и Бобошин (мужская).