Фамилия Бобош — редкий случай, когда прозвище перешло в наследственное имя почти без изменений, без типичных русских суффиксов -ов, -ин или -ский. Она образована напрямую от прозвища Бобош. В славянской ономастике такие «голые» фамилии чаще встречаются у украинцев, белорусов и поляков, поэтому логичнее всего искать корни фамилии в западных или юго-западных регионах бывшей Российской империи.

Основа прозвища — «боб». Бобошем в народе могли назвать человека за несколько черт. Самое прямое объяснение: так могли прозвать того, кто выращивал бобы, торговал ими или часто ел бобовые — по аналогии с фамилиями Горохов, Чечевицын. Но есть и переносный смысл: в говорах «бобом» иногда называли невысокого, полного, «круглого» человека. Окончание -ош характерно для южнославянских и румынских языков (сравните с фамилией Бобош из Венгрии или Румынии), что указывает на возможное влияние соседних народов или миграцию предка.

Менее вероятная, но возможная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках слово «бобо» означает «дед, предок, старейшина», а аффикс -ш мог дать уменьшительную или уважительную форму. В этом случае Бобош — почтительное прозвище уважаемого старца или главы рода. Однако для славянской среды такое объяснение менее типично, чем простое прозвище от бобов.

Сословно фамилия не маркирована: её могли носить и крестьяне, и казаки, и мещане. В дореволюционных метрических книгах Бобоши встречаются в Подольской губернии, на Волыни и в Бессарабии. География подтверждает, что фамилия скорее украинско-молдавского пограничья, чем великорусская. Суффикса -ов в фамилии нет, поэтому её склонение остаётся неизменным для мужчин и женщин (Иван Бобош, Анна Бобош), что тоже типично для западных славянских фамилий.

Если искать однокоренные аналоги, то на востоке фамилия могла бы звучать как Бобов или Бобков, но форма Бобош сохранила исходное прозвище в более архаичном виде. Так что предок носителя этой фамилии с высокой вероятностью был либо огородником-бобоводом, либо человеком с характерной округлой фигурой, жившим на стыке славянского и румынского миров.