Фамилия Бобовников образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Бобовников восходит к прозвищу Бобовник, в основе которого лежит нарицательное «боб» в значении «любое зернышко стручковых растений: фасоли, гороха». Однако суффикс –ник, как правило, указывает на профессию, род занятий. Таким образом, прозвище Бобовник мог получить человек, выращивавший или продававший бобы. Согласно другой версии, в основе этой фамилии лежит название растения бобовник (низкий кустарник из семейства розановых). Это растение характерно для степной полосы России, Южной Сибири. Из зерен бобовника в Саратовской губернии в старину приготовляли молоко, которое пили с чаем. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бобовник, со временем получил фамилию Бобовников. О точном месте и времени возникновения фамилии Бобовников в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Бобовников представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.