Фамилия Боглаенко образована по одной из самых распространённых в восточной Украине моделей — с суффиксом -енко, который в XV–XVIII веках закрепился как фамильный и означал «сын» или «потомок». Основа фамилии — Боглай, личное прозвище или вариант имени, которое нам предстоит разобрать.

Самая вероятная версия связывает корень со словом «бог». В украинской и южнорусской народной среде существовали прозвища, образованные от слова «бог» с разными суффиксами: Богдан, Божко, Богила. Боглай могло возникнуть из «Бог» + суффикс -лай, который встречается в прозвищах (сравните: Пугало → Пугалай, Хрип → Хриплай). То есть Боглай — тот, кто имеет отношение к богу, возможно, набожный человек или, напротив, получивший имя-оберег от сглаза. Менее убедительна версия о связи с тюркским словом «бог» (бык) — для украинской ономастики это нетипично, хотя полностью исключать тюркское влияние на южных территориях нельзя.

Географически фамилия Боглаенко тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Черкасской, Полтавской и Кировоградской областям. Там фамилии на -енко встречаются чаще всего. В России носители редки, в основном это потомки переселенцев конца XIX — начала XX века.

Социальный контекст типичен для казацкой и крестьянской среды. Прозвище Боглай мог получить либо рядовой казак, либо крестьянин, отличавшийся религиозностью или, наоборот, получивший ироничное прозвище «божий человек» за простодушие. Фамилия не указывает на дворянское происхождение — суффикс -енко в малороссийской традиции был фамилией простого сословия, а не шляхты.

В написании фамилии встречается вариант с одной «о» — Боглаенко, и с двумя — Боголаенко, но первый вариант преобладает. Ударение, как правило, падает на второй слог: Бог-ла-Ен-ко.