Фамилия Боголапова — женская форма, а мужская, Боголапов, происходит от прозвища или мирского имени Боголап. Это составное имя, где первая часть — «Бог», а вторая — «лапа». Звучит необычно, но в русской ономастике такие модели встречаются: например, фамилии Богоявленский, Богомолов, Боголюбов. В случае с Боголаповым корень «лап» почти наверняка отсылает к животному — медвежья лапа, волчья лапа. Прозвище Боголап могли дать человеку крупному, неуклюжему, с большими руками или ногами, но с оттенком божественного покровительства — этакий «божий медведь».

Вероятнее всего, фамилия образовалась в крестьянской или посадской среде. Суффикс -ов указывает на типичную модель русских фамилий XVI–XVII веков: «чей?» — Боголапов, то есть сын Боголапа. В дохристианской и раннехристианской традиции на Руси было принято давать «обережные» имена, которые сочетали сакральное и бытовое, чтобы уберечь ребёнка от злых сил. Имя Боголап звучит именно так — защитное, с намёком на силу и простоту.

Встречается и альтернативная, менее правдоподобная версия: что «лапа» здесь — искажённое «лапоть» или «лапта», но она не выдерживает критики, так как в документах и переписях фиксируется именно форма Боголапов, а не Боголаптев. Географически фамилия редкая, распространена в основном в центральных и северных регионах России — в Вологодской, Костромской, Ярославской областях, где такие прозвища были в ходу.

Самый известный носитель фамилии — советский и российский учёный-медик, хирург Иван Ильич Боголапов (в некоторых источниках — Боголапов), но сведений о нём в открытых данных немного. В целом, фамилия Боголапова — редкий пример того, как в одном слове соединились религиозный символизм и грубоватый бытовой юмор, характерный для русской народной антропонимии.