Фамилия Боготова — довольно редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия в привычном смысле, а диалектное слово с очень конкретным, почти географическим значением. В вологодских говорах «богот» — это омут, подводная котловина, а в ярославских диалектах так называли «бучало», то есть омут под мельничным колесом. Именно эта вторая, ярославская версия и подсказывает наиболее вероятное занятие предка: основатель рода Боготовых, скорее всего, был мельником. Прозвище Богот он получил по месту работы — по тому самому омуту, который образуется под колесом мельницы.

Впрочем, возможен и другой, менее «профессиональный» вариант. Прозвище могли дать человеку, чей дом стоял у глубокого водоема, или тому, кто пережил неприятный случай, связанный с водой — например, тонул в омуте. В любом случае, прозвище было «говорящим»: оно привязывало человека к конкретному месту или событию, понятному окружающим без лишних пояснений. Сама фамилия образовалась по стандартной русской модели: к основе «Богот» добавился суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Богота), а женская форма Боготова закрепилась за потомками уже независимо от пола.