Фамилия Боготов в основе своей имеет прозвище Богот. Слово это диалектное, и его значение напрямую связано с водной стихией. В вологодских говорах «богот» — это омут, подводная котловина. В ярославских диалектах слово уточняется: боготом называли «бучало», то есть омут под мельничным колесом.

Именно это уточнение — «под мельничным колесом» — даёт ключ к возможному роду занятий предка. Скорее всего, основатель рода Боготовых был мельником. Прозвище Богот в таком случае носило профессиональный характер: человека могли так назвать по месту его работы, по тому самому омуту у мельницы. Это самая прямая и логичная версия.

Однако связь с омутом могла быть и иной, не профессиональной. Дом предка мог стоять у глубокого водоёма, или же с ним самим мог быть связан случай на воде — например, он тонул в омуте. Такие бытовые, нередко драматичные обстоятельства тоже становились поводом для прозвища, которое затем закреплялось в фамилии.

Словообразовательная модель проста: к основе «Богот» добавился типичный русский суффикс принадлежности -ов. Таким образом, Боготов — это буквально «сын Богота», потомок человека, носившего прозвище Богот. Фамилия относится к самой массовой группе русских фамилий (на -ов/-ев), что говорит о её давнем бытовании в крестьянской среде.

Примечательно, что фамилия эта редкая и географически привязана к северным и центральным областям России — как раз к тем регионам, где слово «богот» было в ходу. Это не случайное совпадение, а прямое указание на локальные корни рода.