Фамилия Боховкин — редкий случай, когда географическая точка почти наверняка перевешивает прозвищную версию. Основа здесь — топоним Боховка или Бохово. На карте России таких названий единицы, и самое вероятное место — деревня Боховка в бывшем Елецком уезде Орловской губернии (сейчас Липецкая область). Человек, переехавший оттуда в другую местность, получал прозвание «Боховка», а его потомки оформляли фамилию через типичный патронимический суффикс -ин: Боховкин — буквально «сын Боховки».

Суффикс -ин здесь первичен: он указывает на принадлежность к конкретному лицу или месту, в отличие от -ов/-ев, который чаще встречается у фамилий от мирских имён. Если бы фамилия образовалась напрямую от прозвища Бох, мы бы скорее увидели вариант Бохов или Бохин, но не Боховкин. Двойной суффикс -овк-ин встречается редко и почти всегда сигнализирует о топонимическом происхождении: сначала от названия села образовалось прозвище на -ка, затем от него — фамилия.

Что касается самого названия Боховка, оно могло пойти от прозвища Бох, которое в южнорусских говорах иногда давали полному, медлительному человеку (от диалектного «бохнуть» — ударить, стукнуть, или от «бох» — боров, кабан). Но это вторичная версия. Первично — название деревни, а его корень мог быть и вовсе не славянским: в документах XVI–XVII веков на орловщине встречаются следы балтской гидронимии, и Боховка могла получить имя от речки с древним корнем.

По сословию предки Боховкиных скорее всего были однодворцами или государственными крестьянами — именно в Елецком уезде в XVIII–XIX веках было много таких семей, носивших фамилии по названиям окрестных сёл. Дворянских родов с такой фамилией в родословных книгах не зафиксировано. Фамилия редкая, в современных справочниках встречается эпизодически, но плотность её сохраняется в Липецкой и соседних областях — там, где стояла та самая Боховка.