Фамилия Болобина образована от прозвища Болоба. Его основа — древнерусское слово «балаба», которое означало «хлебец, колобок, каравай». Поэтому Болобой чаще всего называли пекаря, мастера по выпечке хлеба. Вполне возможно, что прозвище указывало и на внешность предка: в старину полного, круглого человека могли прозвать Болобой — по сходству с тем же колобком.

Есть и третья версия, хотя и менее вероятная. В словаре Даля встречается слово «баляба» — так в архангельских говорах называли разиню, невнимательного человека. Если допустить, что в основе лежит именно этот корень, то прозвище могло закрепиться за нерасторопным или рассеянным человеком.

Фамилия Болобина — женская форма, а её мужской вариант, Болобин, образован по стандартной модели: к прозвищу на -а добавили притяжательный суффикс -ин, означающий «сын Болобы», «род Болобы». Такая модель типична для русских фамилий, возникших в центральных и северных регионах России. Потомок человека с прозвищем Болоба со временем получил фамилию Болобин, а затем и Болобина.