Фамилия Болотина — типичный пример «географического» прозвища, которое закрепилось в роду. В её основе лежит слово «болото», и первое, что приходит на ум: Болотины — это потомки человека, жившего на сырых, топких землях. Прозвище Болота давали либо крестьянину, чей двор стоял у болота, либо тому, кто промышлял на болотистых угодьях — собирал ягоды, рубил торф.

Однако здесь есть и более интересный, мифологический слой. Согласно второй версии, фамилия могла произойти от прозвища Болотник. В славянской традиции болотником называли водяного или злого духа, живущего в трясине. Это имя давали детям не в обиду, а с обережной целью: считалось, что злые силы не тронут того, кто уже назван их именем. Такой обычай был распространён на Руси до XVII века, и фамилия Болотина вполне могла возникнуть из этого обрядового прозвища.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Болотина — «дочь (или жена) Болоты». Это одна из самых древних моделей русских фамилий, характерная для северных и центральных областей России. В мужском варианте фамилия звучит как Болотин.

Одно из первых документальных упоминаний родственной фамилии относится к 1473 году. В звенигородских исторических бумагах записан Леонтий Афанасьевич Болотников. Эта форма на -ов указывает на ту же основу, но образована по другой модели. Сам факт говорит о том, что прозвище Болота было в ходу уже в XV веке, причём у служилых людей, а не только у крестьян.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Болотина отличается от более частых Болотниковых или Болотовых именно суффиксом -ин. Это может указывать на более раннее закрепление фамилии или на её происхождение в среде, где преобладала именно эта модель (например, в Новгородской земле). Сейчас фамилия встречается по всей России, но чаще — в регионах с обилием озёр и болот: в Вологодской, Архангельской, Тверской областях.