Фамилия Болотников восходит к прозвищу Болотник – житель болотистых мест. Одно из первых упоминаний фамилии относится к концу XV века: в исторических документах записан Болотников Леонтий Афанасьевич, 1473 г., Звенигород. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Болотник, со временем получил фамилию Болотников.