Фамилия Бонадыков — один из тех случаев, когда простое, на первый взгляд, прозвище оказывается связанным с именем, уходящим корнями в глубину европейской истории. В ее основе лежит имя Бонадык, которое является народной, разговорной формой крестильного имени Бенедикт. Для русского уха это имя звучало непривычно, поэтому в быту его переиначивали, приспосабливая к привычному звуковому строю.

Сам Бенедикт — имя древнее и значимое. В переводе с латыни (benedictus) оно означает «благословенный». Покровителем этого имени считается Бенедикт Нурсийский, живший в V–VI веках. Он основал первый в Европе монашеский орден — бенедиктинцев, и его нередко называют «отцом западного монашества». Святой Бенедикт почитается как покровитель Германии, итальянского Палермо и английского Сандерленда, а также заступник школьников, преподавателей, земледельцев, музыкантов и художников. В 1964 году папа Павел VI провозгласил его покровителем всей Европы.

В русской традиции имя Бенедикт давали достаточно редко, поэтому и фамилия Бонадыков встречается нечасто. Суффикс -ов указывает на типичную модель образования русских фамилий: так называли сына или потомка человека по имени Бонадык. То есть Бонадыков буквально означает «сын Бонадыка».

Сведения о носителях фамилии встречаются в разных уголках страны. Например, в источниках Амурской области упоминается Ефросинья Антоновна Бонадыкова, родившаяся в 1931 году в селе Рочеборок Березинского района Минской области. Эта запись интересна тем, что связывает фамилию с белорусскими корнями: в Беларуси и на западе России форма Бонадык могла бытовать активнее, чем в центральных или восточных регионах. Таким образом, фамилия Бонадыков — редкий пример того, как латинское по происхождению имя, пройдя через народную переработку, закрепилось в русской фамильной традиции.