Фамилия Бонадыкова в своей основе восходит к мужскому имени Бонадык — народной, разговорной форме канонического имени Бенедикт. Имя Бенедикт латинского происхождения, означает «благословенный». В истории христианства этот корень прочно связан с Бенедиктом Нурсийским, основателем ордена бенедиктинцев и «отцом западного монашества». Святой Бенедикт почитается как покровитель Европы (этот статус закреплён папой Павлом VI в 1964 году), а также заступник школьников, земледельцев и музыкантов. Однако фамилия Бонадыкова, судя по модели образования, не дворянская, а крестьянская или мещанская: суффикс -ов (-а) указывает на принадлежность («чей?»), то есть буквально «дочь или жена Бонадыка». Так окрестили в быту человека, носившего полное церковное имя Бенедикт, — для русского уха оно звучало непривычно, и его переделали в более простое Бонадык.

Географический след фамилии узкий, но показательный. В открытых источниках встречается запись о Ефросинье Антоновне Бонадыковой, родившейся в 1931 году в селе Рочеборок Березинского района Минской области. Эта запись — не случайность: фамилия с корнем Бонадык- встречается преимущественно в западных регионах бывшей Российской империи, где католическое имя Бенедикт было распространено шире, чем в центральной России. Белорусское и польское влияние здесь очевидно: в польском языке имя Benedykt дало форму Bonadyk через характерное чередование звуков, и на славянской почве оно закрепилось именно в таком виде.

Таким образом, Бонадыкова — не частая фамилия, но с прозрачной этимологией. Она не указывает на род занятий или прозвище, а напрямую ведёт к имени предка, которого в крещении нарекли «благословенным».