Фамилия Бонадыов — один из тех редких случаев, когда написание говорит о происхождении больше, чем звучание. Ударение, скорее всего, падает на последний слог: Бонадыо́в. Необычное сочетание «ыо» в корне — верный признак того, что перед нами не исконно русская фамилия, а русифицированная версия иноязычной.

В основе лежит, по всей видимости, французская или итальянизированная фамилия Бонадьё (Bonadieu) или Бонадио (Bonadio). «Bon Dieu» по-французски значит «добрый Бог», а «Bonadio» в итальянских диалектах — имя-пожелание, образованное от того же корня. Такие фамилии могли давать в католических семьях как благочестивое прозвище или как имя, полученное при крещении. В России носители этой фамилии — почти наверняка потомки иностранных специалистов, приглашённых в XVIII–XIX веках: архитекторов, инженеров, военных или учителей, которые осели в империи и обрусели.

Модель образования проста: к иностранной основе Бонадьё или Бонадио добавили русский патронимический суффикс -ов. Так появилось Бонадыов, где «ы» встало на место мягкого «дь» или «ди» — это типичная адаптация западноевропейских фамилий в русской среде. Суффикс -ов указывает, что фамилию носил человек, принадлежавший к роду Бонадыо, то есть сын или потомок Бонадыо.

Географически фамилия крайне редкая и встречается точечно. Судя по доступным данным, её носители проживают в основном в центральных регионах России и на юге, что косвенно подтверждает версию о переселенцах из числа французских или итальянских колонистов, которых в разное время привлекали на сельскохозяйственные работы в Новороссию и на Кавказ.

Спорных версий здесь немного. Можно было бы предположить связь с тюркским или кавказским корнем, но сочетание «ыо» для этих языков нетипично. Французское происхождение выглядит самым логичным: оно объясняет и редкую орфографию, и способ русификации. Фамилия Бонадыов — не просто «иностранная», а живой след того, как европейское имя превратилось в русскую фамилию, сохранив в написании память о своём исходном звучании.