Фамилия Бонокин — один из тех случаев, когда внешне простая основа скрывает несколько возможных путей происхождения, и выбрать единственный вариант непросто. В ней отчетливо выделяется суффикс -ин, который в русских фамилиях обычно указывает на принадлежность: «чей?» — Бонокин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Бонока. Основа фамилии — Бонок-, а вот что она означала, требует разбора.

Самая прямая версия отсылает к диалектному слову «боня» или «бонька». В некоторых говорах, особенно в южнорусских и украинских, так называли бочку, кадку или вообще любую емкость для жидкостей. Человек по прозвищу Бонока мог быть бондарем — мастером по изготовлению бочек. Суффикс -ок в прозвище (Бонок) мог придавать уменьшительный или пренебрежительный оттенок, но в основе фамилии он закрепился. Таким образом, предок Бонокин, скорее всего, имел отношение к бондарному ремеслу либо получил прозвище за плотное, «бочкообразное» телосложение.

Вторая версия ведет к крестильному имени. В старину существовало редкое каноническое имя Вонифатий (от лат. «благодетель»), в народной речи сокращавшееся до Боня или Бонята. От уменьшительной формы Бонок (через чередование согласных) вполне могла образоваться фамилия. Эта гипотеза менее вероятна, потому что массовых следов такого сокращения в документах не зафиксировано, но исключать ее нельзя — в русской ономастике встречаются и более неожиданные трансформации.

Фамилия Бонокин — редкая. Она не входит в сотни самых распространенных, и ее география довольно узка. Встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, а также в Поволжье. Встречаются варианты написания с одной «н» — Бонокин, что не меняет сути. Сословная принадлежность носителей фамилии, скорее всего, была крестьянской или мещанской: бондарное ремесло считалось городским или сельским промыслом, но не дворянским занятием.

С точки зрения словообразования, фамилия Бонокин стоит в одном ряду с однокоренными Бондарев, Бондаренко, Бондарчук, но отличается именно суффиксом -ок в основе, что делает ее более «камерной» и личной — прозвище, а не прямое указание на профессию. В отличие от фамилии Бондарев, где сразу слышен ремесленник, Бонокин звучит как прозвание конкретного человека: «Бонок, сын такого-то». Именно эта деталь — суффикс субъективной оценки — и выделяет фамилию среди более распространенных профессиональных аналогов.