Фамилия Бошняков — довольно редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней слышится что-то южное или балканское, но на деле она почти наверняка исконно русская, хотя и с необычной основой.

Разобрать её помогает география и типичная для русского Севера модель. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Бошняков — сын Бошняка. А вот прозвище Бошняк — ключ к разгадке. Скорее всего, оно связано с диалектным словом «бошняк» или «башняк». В архангельских и вологодских говорах так называли человека родом с Балтийского побережья, из шведских или немецких земель. Слово восходит к искажённому «боцман» или, по другой версии, к названию народа «боснийцы» (босняки), но в русской деревне оно закрепилось за любым чужеземцем-моряком или пришлым с запада.

Есть и более прозаичная версия: Бошняк — это человек, живущий в «бошне», то есть в башне, сторожевой вышке. В условиях пограничья или монастырских владений такое прозвище давали сторожу или караульному. Обе гипотезы ведут к одной социальной среде: не дворянской, а крестьянской или посадской, где прозвище цеплялось к человеку по его занятию или месту прежнего жительства.

Надёжно засвидетельствована фамилия в северных уездах: в переписях XVII–XVIII веков Бошняковы встречаются в Вятке, на Устюге Великом и в Сибири, куда северян переселяли. Самый известный носитель — Николай Бошняков, офицер русского флота, исследователь Сахалина и Приамурья, что косвенно подтверждает «морской» след прозвища. В отличие от фамилий на -ский, Бошняков не указывает на владение землёй — это фамилия-прозвище, возникшая в народной среде и закрепившаяся за потомками того самого Бошняка.