Фамилия Боттаева — женская форма фамилии Боттаев. Её происхождение напрямую связано с мужским именем или прозвищем Боттай, а оно, в свою очередь, восходит к тюркскому корню «бот» — «верблюжонок», «детёныш верблюда». В тюркских языках, особенно в кумыкском, ногайском, карачаево-балкарском, слово «бота» означает именно молодого верблюда. Имя Бота, Боттай давали в старину с пожеланием силы, выносливости и способности переносить трудности — тех качеств, которые в степи ценились превыше всего.

Фамилия образована по очень распространённой на Кавказе модели: к основе Боттай добавили русский патронимический суффикс -ев (вариант -ов для основ на мягкий согласный или -й). Так из имени или прозвища отца сделали фамилию для всего рода. Подобный способ словообразования типичен для народов Северного Кавказа, чьи фамилии оформлялись по русскому образцу в XIX — начале XX века. То есть Боттаев — буквально «сын Боттая», а Боттаева — «дочь» или «жена» из этого рода.

Интересна двойная «т» в корне. В исходном имени Боттай одна «т», а в фамилии их две. Это не ошибка, а результат того, как русская письменность передаёт тюркское произношение: звук «т» на стыке корня и суффикса (Ботт-ай) мог произноситься более напряжённо, с лёгким придыханием, и на письме это закрепилось как удвоение. Встречаются и варианты написания с одной «т» — Ботаев, Ботаева, но форма с двумя — основная и более старая.

Географически фамилия Боттаева чаще всего встречается в Кабардино-Балкарии, Карачаево-Черкесии, а также среди кумыков Дагестана. Носители фамилии — потомки скотоводов, коневодов и воинов, для которых верблюд был не просто животным, а символом богатства и статуса. Никаких сведений о дворянском происхождении фамилии нет — она крестьянская и горская, что не делает её менее древней.

Изредка фамилию могут связывать с иранским «бота» — «идол», «кумир», но для тюркской среды это значение маловероятно и не подкреплено ареалом распространения.