Фамилия Брагаренко образована по распространённой в украинской и южнорусской ономастике модели: к основе прозвища добавлялся суффикс -енко, который первоначально означал «сын» или «потомок». То есть Брагаренко — это буквально «сын Брагаря». Такая форма указывает на украинское или белорусское происхождение фамилии, так как именно в этих регионах суффикс -енко был основным способом обозначения родства, в отличие от великорусских -ов/-ев и -ин.

Основа фамилии — прозвище Брагарь. Оно напрямую связано со словом «брага» — старинным хмельным напитком, который варили из солода, муки или хлеба. В словаре В. Даля «брага» определяется как «домашнее пиво», «корчажное пиво» или «сыровец». Соответственно, Брагарем могли назвать человека по двум причинам. Первая, самая очевидная: любитель браги, тот, кто её часто пил. Вторая, не менее вероятная: человек, который делал брагу и торговал ею — своего рода пивовар или корчмарь. Вторая версия выглядит более правдоподобной для закрепления прозвища в качестве фамилии: ремесленное или торговое занятие чаще становилось устойчивым семейным именем, чем бытовая привычка.

Интересно, что фамилия Брагаренко не так широко распространена, как, например, Брагин или Брагов. Это говорит о её более локальном бытовании, скорее всего, в центральных или восточных областях Украины, где модель на -енко была особенно продуктивной. Встречается и вариант без суффикса — Брагарь, но он значительно реже.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Брагин (с суффиксом -ин) — типично русская форма, указывающая на принадлежность к человеку по прозвищу Брага. Брагаренко же — форма «патронимическая», то есть прямо указывающая на отца: «чей сын?» — Брагаренко. Такое различие в суффиксах — яркий пример того, как один и тот же корень дал разные фамилии в зависимости от региона и языковой традиции.