Фамилия Бубет — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет типичных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, поэтому её корни стоит искать не в стандартной модели «отчество от имени или прозвища», а в иноязычных заимствованиях или прозвищных основах, которые не получили широкого распространения.

Скорее всего, фамилия Бубет имеет тюркское или западноевропейское происхождение. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) встречается слово «бубет» или близкие по звучанию формы, означающие «сильный», «крепкий», «могучий». Если это так, то фамилия образована от прозвища, которое давали физически развитому, выносливому человеку. Такие прозвища нередко становились фамилиями у народов Поволжья и Приуралья.

Другая версия — немецкое или польское происхождение. В немецком языке есть фамилия Bube (буквально «мальчик», «парень») с уменьшительным суффиксом -et. Переселенцы из Германии или поляки, попав в русскоязычную среду, могли адаптировать написание, и Bube превратился в Бубет. В пользу этой гипотезы говорит и окончание -ет, которое нехарактерно для исконно русских фамилий, но встречается в фамилиях немецких колонистов (например, Брунет, Вальтер).

Встречаемость фамилии крайне низкая. По открытым данным, носители Бубет живут в основном в южных регионах России (Краснодарский край, Ростовская область) и на Украине. Это тоже косвенно указывает на возможные миграционные пути — либо из Крыма и Причерноморья (где были тюркские народы), либо от немецких колонистов, селившихся в Новороссии.

Однозначного ответа, откуда пошла фамилия, нет. Но наиболее правдоподобной выглядит версия о тюркском прозвище «крепкий, сильный» — она объясняет и форму слова, и смысл, и географию. Вариант с немецким «мальчиком» менее вероятен, так как в немецком фамилии на -et редки и обычно не переходили в русский язык без изменений.