Фамилия Бубеева образована от прозвища Бубей, и её происхождение связано с несколькими возможными источниками. Наиболее убедительная версия ведет прозвище к украинскому слову «бубка» — «ягода». В таком случае Бубей мог быть прозвищем человека, занимавшегося сбором или выращиванием лесных ягод на продажу — то есть указанием на ремесло основателя фамилии. Однако слово «бубка» в украинских говорах имело и другие значения: так называли глашатая или просто словоохотливого, общительного человека. Поэтому прозвище могло закрепиться за говорливым или крикливым предком.

Согласно другой гипотезе, в основе лежит слово «буба» — «ушиб, опухоль, болячка». В этом случае прозвище Бубей выполняло охранительную функцию: родители намеренно давали ребёнку «некрасивое» имя, чтобы обмануть злых духов и уберечь его от болезней. Надеясь вырастить здорового и красивого мальчика, они называли его Бубеем — как оберег.

Обратите внимание на суффикс -ев в фамилии. Он указывает на принадлежность: Бубеев — это «сын Бубея» или «из рода Бубея». Такая модель образования типична для русских фамилий, но основа Бубей — редкая и не имеет массовых однокоренных аналогов, что делает фамилию локальной по происхождению. Скорее всего, она закрепилась в южнорусских или украинских регионах, где слово «бубка» было в ходу.

В итоге фамилия Бубеева хранит память либо о занятии предка (сборщик ягод или глашатай), либо о древнем обычае давать ребёнку имя-оберег. Точную версию без генеалогических изысканий определить трудно, но обе они правдоподобны и отражают бытовую культуру прошлого.