Фамилия Бубон — одна из тех, где значение упирается в язык, на котором смотреть. Если читать её по-русски, первое, что приходит в голову, — «бубон», то есть «желвак, нарыв, опухоль железы». Прозвище Бубон в этом случае могли дать человеку с заметной внешней особенностью — например, с шишкой или большой грыжей. Версия правдоподобная, но не единственная и, возможно, не главная.

В украинском языке то же самое слово «бубон» означает совсем другое — бубен, ударный инструмент в виде обода с натянутой кожей. Тут прозвище переходит в разряд профессиональных: Бубоном могли назвать мастера, который делал бубны, или музыканта, который на них играл. В переносном смысле так могли окрестить и говорливого человека — того, кто «гремит» без умолку, или обладателя звонкого, громкого голоса.

С точки зрения словообразования фамилия относится к простейшей модели: прозвище без дополнительных суффиксов перешло в фамилию напрямую. Такое часто встречается на западе и юге России, а также на Украине, где фамилии вроде Голуб, Сокол или Бубон — не редкость. Суффикса -ов или -ин здесь нет, а значит, фамилия сохранила исходное прозвище почти без изменений.

Интересно, что фамилия Бубон встречается и в польской, и в белорусской ономастике. В польском языке «bęben» — тоже «барабан», и фамилия Bęben или Bąbel известна с XVI века. Русский вариант Бубон мог возникнуть как фонетическая адаптация польской или украинской основы. Это нередкий случай, когда одна и та же фамилия в разных славянских языках имеет разные корни, но звучит одинаково.

Таким образом, у фамилии Бубон как минимум три равноправных пути: медицинское прозвище по внешности, ремесленное — по профессии, и образное — по характеру. Выбор между ними зависит от того, в какой среде и где именно фамилия закрепилась. Если предки жили на Украине или в Белоруссии, версия с бубном и говорливостью выглядит убедительнее. Если фамилия возникла в великорусских говорах — не исключено, что в основе лежит старый диалектный «бубон» в значении «нарыв».