Фамилия Бугеренко — характерный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. Этот суффикс, один из самых распространённых в украинской ономастике, изначально имел значение «маленький, сын такого-то». То есть Бугеренко — это «сын Бугера» или «потомок Бугера». Такие фамилии массово закреплялись в казацкой среде и среди крестьянства Левобережной и Слободской Украины в XVII–XVIII веках.

Основа фамилии — прозвище Бугер. Его происхождение вызывает споры, но наиболее убедительная версия связывает его с диалектным словом «бугер». В южнорусских и украинских говорах так называли холм, бугор, возвышенность. Прозвище Бугер могли дать человеку, жившему на возвышенности, или тому, кто выделялся статью — был высоким, плотным, «как бугор». Менее вероятна, но встречается в любительских этимологиях связь с французской фамилией Бугер (Bouguer) — например, известного геодезиста Пьера Бугера, — но для украинской фамилии это явно натянутое объяснение, лишённое исторической почвы.

В письменных источниках фамилия встречается с XIX века, преимущественно в документах Харьковской, Полтавской и Екатеринославской губерний. Это указывает на ареал формирования — Слобожанщина и Приднепровье. Встречается также вариант написания Бугеренко с ударением на второй или третий слог, что характерно для разных говоров.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -енко, образованных от крестильных имён (Иваненко, Петренко), Бугеренко восходит к прозвищу по признаку местности или внешности. Это говорит о том, что первый носитель прозвища не был сыном человека по имени Бугер (такого имени нет в святцах), а получил прозвище по характерной черте — и уже от этого прозвища пошла фамилия. Такие случаи показывают, насколько тесно бытовая жизнь и ландшафт влияли на формирование родовых имён.

Сословно фамилия не элитарная: её носители — в основном казаки и крестьяне. Дворянских родов Бугеренко в Российской империи не зафиксировано. Сегодня фамилия остаётся редкой, встречается в основном на востоке Украины и в южных областях России, куда мигрировали украинские переселенцы в XIX–XX веках.