Фамилия Бухня — редкий случай, когда прозвище перешло в наследственное имя практически без изменений, минуя типичные фамильные суффиксы. В русской традиции фамилии на -ня обычно имеют украинское или белорусское происхождение, где этот суффикс образует названия действий или предметов. Но в данном случае основа, скорее всего, чисто русская.

Корень «бух-» многозначен. Самая вероятная версия — прозвище Бухня дали человеку с громким, резким голосом или шумному, несдержанному в поведении. Глагол «бухать» в говорах означал не только «падать с грохотом», но и «кричать», «браниться», а также «глухо звучать». Так могли прозвать и того, кто работал с бочарным инструментом (бухарем), или просто любителя пошуметь.

Вторая, менее очевидная, но правдоподобная версия отсылает к ремеслу. В некоторых диалектах «бухня» — это то же, что «бухло» или «бухалово», то есть хмельной напиток. Прозвище мог получить пивовар, бражник или содержатель питейного заведения. Однако, учитывая, что фамилия не получила распространения (она встречается лишь точечно, в основном на юге России), версия с поведением выглядит убедительнее.

Примечательно, что фамилия не обросла типичными окончаниями -ов, -ев или -ин. Это говорит о том, что она закрепилась в среде, где фамилии ещё не прошли полную унификацию — например, среди однодворцев или казачества, где прозвища часто становились официальными фамилиями без изменений. В современных справочниках фамилия Бухня не значится среди распространённых, что делает её уникальным маркером для носителей: предки явно выделялись на фоне соседей либо характером, либо занятием.