Фамилия Чарнцева образована от прозвища Чарнец. По одной из версий, оно ведет свое начало от гидронима Чарень — река в Карелии. Вероятно, основатель фамилии родился или жил на берегу этой реки. Возможно также, что основой для прозвища послужило нарицательное «чаронка» - «род глиняной плошки, миски». В таком случае прозвище относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность предка: он мог быть гончаром. Согласно еще одной гипотезе, прозвище восходит к слову «чары» - «сибирская обувь». Поэтому Чарнецом, предположительно, прозвали сапожника или торговца обувью. Наконец, прозвище Чарнец могло указывать на особенности внешности человека, а именно на его особенную, чарующую красоту. Хотя не исключено, что Чарнцем окрестили знахаря. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Чарнец, со временем получил фамилию Чарнцева.