Фамилия Чарочкина образована от мужского варианта Чарочкин. В её основе лежит слово «чарка» — небольшой сосуд для питья крепких напитков, чаще всего вина или водки. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Чарочкин — сын или потомок человека, которого в округе прозвали Чарочкой. Такое прозвище могли дать по разным причинам. Самая прямая — любовь к выпивке, но необязательно с осуждающим оттенком: в крестьянской среде «чарочником» называли и того, кто любил угощать, или бойкого, весёлого человека, без которого не обходилось застолье. Реже прозвище могло закрепиться за мастером, делавшим чарки, — то есть за ремесленником-серебряником или деревянных дел мастером, изготавливавшим ритуальную и бытовую посуду.

В документах фамилия Чарочкин встречается нечасто, что говорит о её сравнительной редкости. По данным переписей XIX века, носители фамилии были рассеяны в центральных губерниях России — преимущественно в Тверской, Ярославской и Московской. Это характерно для прозвищных фамилий, возникших не от имени, а от бытового слова: они редко давали большие гнёзда, зато хорошо сохраняли локальный колорит. Интересно, что в некоторых говорах «чарка» имела и переносное значение — так называли небольшую меру сыпучих тел, а в псковских диалектах — даже вид гриба. Однако для фамилии основным остаётся «питейный» корень.

Словообразовательная модель проста и прозрачна: усечённая основа «чарочк-» (от «чарочка» — уменьшительно-ласкательная форма от «чарка») плюс притяжательный суффикс -ин. Ударение в фамилии обычно падает на второй слог — Чаро́чкин, что соответствует естественному русскому произношению слова «чарочка». Ошибочный вариант с ударением на первый слог встречается реже и, как правило, связан с региональными особенностями речи.