Фамилия Чегис — редкий случай, когда почти наверняка можно говорить о литовском или жемайтском следе, а не о привычной восточнославянской модели. В ней нет ни русского суффикса -ов, ни украинского -енко, ни польского -ский. Окончание -ис выдает происхождение носителя из бывшего Великого княжества Литовского, где такие фамилии массово закрепились в XIX веке после отмены крепостного права.

Основа Чег- восходит к литовскому личному имени или прозвищу. Самый прямой кандидат — Čegis, уменьшительная форма от имени Česlovas (аналог славянского Чеслава). В таком случае фамилия означает «потомок Чегиса», то есть человека по имени Чеслав. Возможна и более прозаическая версия: литовское čegė — «чибис» или «пигалица». Прозвище по птице могли дать за крикливый нрав, манеру одеваться или за то, что человек жил у болота, где водятся эти птицы.

Поскольку литовские фамилии на -ис часто образовывались от прозвищ, а не только от крестильных имен, версия с «чибисом» ничуть не слабее. В пользу этого говорит и то, что в Литве встречается топоним Čegis — название хутора или урочища. Значит, прозвище могло закрепиться и за местом жительства.

В России и Беларуси фамилия Чегис встречается точечно, в основном в регионах, граничивших с Литвой: Смоленская, Брянская области, запад Беларуси. Переселенцы конца XIX — начала XX века занесли ее в Сибирь и на Дальний Восток. Встречаются варианты написания Чегис и Чягис, что отражает особенности литовской орфографии и русской передачи звука č.

Социальный слой, где фамилия возникла, — в основном крестьяне и мелкая шляхта. В Литве личные прозвища стали фамилиями у всех сословий примерно в одно время, поэтому искать дворянские корни стоит только в том случае, если есть документальное подтверждение. Сама по себе фамилия на -ис не указывает на благородное происхождение.