Фамилия Чекачкова — женская форма мужской фамилии Чекачков, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Суффикс -ов- указывает на типичную русскую патронимическую модель: фамилию образовали от прозвища или имени, оканчивающегося на твёрдый согласный. В данном случае основа — «Чекач(к)», что сразу наводит на мысль о слове «чека». Чека — это металлический стержень или клин, который вставляют в отверстие для фиксации деталей, например, в колесе телеги или в орудийном лафете. Прозвище Чека могли дать человеку с характером: либо упрямому и «заклинившему» на чём-то, либо, наоборот, надёжному и скрепляющему коллектив.

Однако есть и вторая, более бытовая версия. В некоторых говорах «чекать» означало «ждать» или «медлить». Чекач — это тот, кто часто медлит, задерживается. В таком случае фамилия перешла бы в разряд «профессиональных» прозвищ по поведению, а не по ремеслу. Но слово «чека» как деталь механизма встречается в документах и фольклоре чаще, чем глагол «чекать», поэтому версия с прозвищем от инструмента выглядит убедительнее.

Географически фамилия Чекачков (и Чекачкова) тяготеет к центральным и южным областям России — встречается в Воронежской, Тамбовской, Рязанской губерниях. Это зона активного кузнечного и тележного промысла, где слово «чека» было обиходным. Интересно, что в тех же краях бытуют однокоренные фамилии Чекалин, Чеканов, Чекалов — они образованы от той же основы, но с разными суффиксами. Чекачков выделяется среди них редким формантом -к- перед суффиксом: Чекач-к-ов. Это могло быть уменьшительной формой прозвища (Чекачок — маленькая чека), либо указывать на сына человека по прозвищу Чекач.

В сословном плане носители фамилии чаще всего были крестьянами или мещанами. Дворянских родов с такой фамилией в гербовниках не зафиксировано. Это не делает её «простой» — напротив, она сохранила прямую связь с ремесленной и бытовой культурой, где каждая деталь (вроде чеки) имела значение.