Фамилия Черниховец — редкий случай, когда географическое происхождение почти очевидно, но не единственное. Основа фамилии — «черн-», связанная с чёрным цветом, тёмными волосами или смуглой кожей. Но ключевой элемент — суффикс «-овец», а не более привычный «-ов» или «-ин». В русской ономастике «-овец» часто указывает на выходца из определённого места: так образовывали прозвища для переселенцев из сёл и городов. Черниховец — это, скорее всего, «человек из Чернихова» или «из Чёрного».

Названий вроде Чернихово, Черниховка или просто Чёрное на карте бывшей Российской империи несколько. Самые вероятные точки — сёла в Беларуси или на западе Украины, где топонимы с корнем «черн-» особенно часты. Фамилия могла закрепиться за крестьянином или мещанином, который перебрался в другое место и получил прозвище по покинутой деревне. В этом случае Черниховец — типичная «географическая» фамилия, каких много: Москвин, Тверитин, Ростовцев.

Есть и вторая, менее очевидная версия. Суффикс «-ец» в фамилиях мог указывать на принадлежность к общине или профессии: кузнец, гончар, стрелец. Тогда Черниховец — не «выходец из», а «тот, кто связан с чем-то чёрным». Например, прозвище могли дать человеку, работавшему с чёрным металлом (кузнецу) или с чёрной краской (красильщику). Но эта версия слабее: обычно профессиональные прозвища образовывались напрямую (Кузнецов, Красильщиков), а не через столь сложную конструкцию.

Фамилия почти не встречается за пределами восточнославянского ареала. В дореволюционных переписях её носители фиксировались в Черниговской, Могилёвской и Киевской губерниях. С точки зрения словообразования, Черниховец — типичная патронимическая или топонимическая фамилия, оформленная по модели, характерной для западнорусских и украинских земель. Суффикс «-ец» в сочетании с основой на «-ов» даёт понять: предок этого человека либо носил прозвище Черних, либо (что вероятнее) был переселенцем из места с таким названием.