Фамилия Чернильщикова — редкий пример того, как профессия, ушедшая в прошлое, застыла в родовом имени. В отличие от распространенных Кузнецовых или Мельниковых, эта фамилия отсылает к очень конкретному и не самому массовому ремеслу. Основа здесь — слово «чернильщик». Так в XIX — начале XX века называли человека, который изготавливал или продавал чернила, а также, возможно, мастера, делавшего чернильницы. В эпоху, когда каждый писарь, чиновник и гимназист зависел от жидких чернил, такой промысел был востребован, но держался на единичных умельцах, а не на цехах.

Суффикс -щик в основе указывает на деятеля по роду занятий (сравните: стекольщик, кровельщик). Далее фамилия образована по стандартной русской модели: к основе «Чернильщик» добавили патронимический суффикс -ов, а женская форма — Чернильщикова — возникла естественным путем как указание на жену или дочь главы семьи. Мужской вариант фамилии — Чернильщиков. Встречается она преимущественно в центральных регионах России, особенно в областях, где было развито кустарное производство и канцелярский промысел, например, в Тверской или Ярославской губерниях.

Любопытно, что фамилия могла возникнуть и как прозвище. Если человек постоянно пачкался чернилами, был писарем или учителем чистописания, его могли в шутку прозвать Чернильщиком. Такие «профессиональные» прозвища часто закреплялись за потомками, даже если сам предок чернил не варил. Однако версия с ремеслом выглядит более прямой и правдоподобной: в переписных книгах и ревизских сказках действительно встречаются записи о «чернильщиках» как о мастерах отдельного профиля.

В словаре русских фамилий Бориса Унбегана эта фамилия не выделена отдельно, но её модель полностью вписывается в описанный им пласт «ремесленных» фамилий на -щиков. Сравните с однокоренными, но более редкими вариантами: Чернильников (от продавца чернильниц) или Чернилкин (от прозвища Чернилка). Фамилия Чернильщикова — не из тех, что можно встретить на каждом шагу, и ее носители, скорее всего, происходят из среды городских ремесленников или мелких служащих, чей труд был тесно связан с письмом и документами.