Фамилия Чернокнижникова — одна из тех, что сразу вызывает вопросы. Её основа лежит на поверхности: «чернокнижник». В старину так называли колдуна, знахаря, человека, связанного с «чёрной книгой» — сборником магических заклинаний и тайных знаний. Однако, как и в случае с многими прозвищами, не стоит буквально представлять предка Чернокнижниковых колдуном. Чаще всего такие фамилии давались не по роду занятий, а по поведению, внешности или отношению окружающих. Например, так могли прозвать нелюдимого, угрюмого человека, которого сторонились и считали «не от мира сего». Или того, кто любил читать старые, непонятные книги, чем пугал соседей.

Словообразовательная модель здесь классическая для русских фамилий: суффикс «-ов» (в женском роде — «-ова») указывает на принадлежность. Чернокнижников — буквально «сын Чернокнижника» или «из рода Чернокнижника». Фамилия образована от прозвища, а не от имени, и это делает её более поздней по происхождению — скорее всего, она закрепилась в XVII–XVIII веках, когда прозвища начали массово переходить в наследственные фамилии. Интересно, что в русских говорах слово «чернокнижник» имело и ироничный оттенок: так могли назвать хитрого, изворотливого мужика, который «знает все ходы и выходы» и умеет обвести вокруг пальца.

Географически фамилия редкая. Она почти не встречается в центральных регионах и на севере, зато её корни, по данным краеведов, уходят в южнорусские и поволжские земли, где сильны были старообрядческие общины. В старообрядческой среде «чернокнижником» могли назвать того, кто пользовался дониконовскими книгами или хранил старые рукописи — для властей и официальной церкви это было почти то же самое, что колдовство. Так что предок Чернокнижниковых мог быть вовсе не колдуном, а просто грамотным книжником-старовером, которого соседи за глаза называли «чернокнижником» за его приверженность древним текстам.

В отличие от более распространённых фамилий вроде Попов или Смирнов, Чернокнижникова — штучная, почти уникальная. В дореволюционных метрических книгах она встречается единично, а после революции, когда многие носители меняли фамилии, чтобы избавиться от «неблагозвучного» прошлого, она могла почти исчезнуть. Сегодня её носители — это либо потомки тех самых книжников, либо люди, чьи предки получили прозвище за необычный характер. Точных цифр нет, но по открытым базам данных Чернокнижниковых в России — не больше нескольких сотен человек, и большинство живёт в Саратовской и Волгоградской областях.