Фамилия Черноногов образована от прозвища Черноног. Оно ведет свое начало от словосочетания «черные ноги». Вероятно, прозвище либо содержало указание на особенности внешности основателя фамилии (смуглая кожа), либо на род деятельности предка (трубочист, дегтярь, чернорабочий), либо на черты его характера и поведение (неаккуратность, неряшливость). Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Черноног, со временем получил фамилию Черноногов.