Фамилия Чернорубашкина — женская форма мужской фамилии Чернорубашкин, которая образована по продуктивной модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Чернорубашкин буквально означал «сын Чернорубашки» или «человек из семьи Чернорубашек». Основа здесь — прозвище Чернорубашка, и разбирать её стоит именно как прозвище, а не как составное имя.

Прозвище Чернорубашка, скорее всего, указывало на внешний признак: человек, который постоянно или по роду занятий носил чёрную рубаху. Это не обязательно цвет траура или бедности. Чёрная рубаха была рабочей одеждой у многих ремесленников — кузнецов, угольщиков, печников, истопников, а также у крестьян, занятых грязной работой. Сажа, копоть и угольная пыль быстро пачкали светлую ткань, поэтому тёмная одежда была практичным выбором. Таким образом, предок носителя фамилии мог быть мастеровым человеком, чья профессия оставляла следы на одежде.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывались от крестильных имён, фамилии на -ин в русской традиции чаще возникали от прозвищ, оканчивающихся на -а/-я. Чернорубашка — типичное бытовое прозвище, которое давали по заметной черте, а не по характеру. Эта модель широко распространена на севере и северо-востоке России, в Поволжье и Сибири, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем в центральных и южных областях.

У фамилии есть однокоренные параллели: Чернорубашкин, Чернорубашников, а также более редкие варианты вроде Чернорубаш. Все они восходят к одному прозвищному корню, но различаются суффиксами, что говорит о самостоятельном, а не родственном возникновении в разных местностях. Фамилия Чернорубашкина не относится к дворянским или книжным — это типичная фамилия крестьянского или мещанского сословия, закреплённая в документах XIX века при переписях.

Встречаемость фамилии невысокая, она не входит в списки распространённых русских фамилий. Основные очаги бытования — Центральная Россия и Поволжье, что согласуется с географией фамилий на -ин от прозвищ, связанных с одеждой и ремеслом.