Фамилия Чибинеев — редкий случай, когда географическая привязка оказывается убедительнее, чем прозрачная этимология. В основе, скорее всего, лежит не личное имя или профессия, а название места, где жил родоначальник. Речь о селе Чибинеевка, которое существовало в Малороссии (нынешняя Черниговская область Украины). Жителей таких сёл в официальных документах могли записывать по местности: «Чибинеевец», «Чибинеевский», а на русской почве фамилия приняла форму на -ев.

Морфологически фамилия выглядит как типичный русский патроним на -ев, но суффикс -еев (а не -ов) указывает на основу, оканчивающуюся на мягкий согласный или -й. Если отбросить окончание, остаётся корень «Чибине-». Что он значит? Прямого значения в русском языке нет. Возможно, это тюркское прозвище: в тюркских языках есть слово «чибин» — «муха», «овод». Прозвище Чибиней могли дать человеку назойливому, суетливому или, наоборот, быстрому, как насекомое. Однако версия с географическим названием выглядит надёжнее, потому что село Чибинеевка реально существует, и фамилия могла возникнуть у крестьян, переселённых оттуда или записанных по месту жительства.

Есть и третья, менее вероятная версия: от имени Чибиня — уменьшительной формы от Чибис (птица). Но для этого в фамилии ожидался бы суффикс -ин (Чибинин), а не -ев. Поэтому Чибинеев — это почти наверняка «выходец из Чибинеевки» или, реже, потомок человека по прозвищу Чибиней. Фамилия недворянская, встречается в основном в центральных и южных областях России, что подтверждает связь с украинскими землями.