Фамилия Чибукина — это женская форма фамилии Чибукин, которая образована по самой распространённой в русском ономастиконе модели: от прозвища или имени с помощью суффикса -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Чибукин буквально значит «сын Чибуки» или «человек из семьи Чибуки».

В основе фамилии лежит прозвище Чибука. Его происхождение, скорее всего, связано с диалектным словом «чибук» или «чубук». В русских говорах «чубук» — это полый стержень для курения, часть трубки. Но у слова есть и другое, менее очевидное значение: в некоторых регионах «чубуком» называли длинный прут, хлыст или даже молодой побег винограда. Человек мог получить такое прозвище за худобу и высокий рост (как прут), за привычку носить с собой трубку или за то, что занимался изготовлением чубуков.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркским словом «чибук» (палочка, ветка). В этом случае прозвище могло закрепиться за пришлым человеком из тюркской среды, которого русские соседи прозвали по характерной детали быта или внешности. Однако для фамилии Чибукин более органично выглядит исконно русская диалектная основа с понятной словообразовательной моделью.

Географически фамилия встречается не повсеместно. Её очаги — традиционные районы расселения русского населения: Поволжье, некоторые области центральной России и Урал. Встречается она нечасто, что и делает её ценной для локальной истории — носители фамилии, скорее всего, происходят из одной или нескольких родственных крестьянских семей, где прозвище Чибука закрепилось как родовое имя.