Фамилия Чубкова — женская форма от Чубков, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель типична для русских фамилий: основа плюс суффикс принадлежности -ов (в женском варианте — -а). Это указывает на то, что фамилия образована от прозвища или имени Чубок, Чубко — скорее всего, уменьшительной формы от слова «чуб». В старину чубом называли прядь волос, хохол, часто — у казаков или крестьян. Человек с заметным чубом, длинными волосами или, наоборот, с выбритым лбом и оставленным оселедцем мог получить прозвище Чуб. От него через патронимический суффикс и возник Чубков — «сын Чуба» или «потомок Чуба».

Второй вариант, менее вероятный, но встречающийся в ономастике: связь с диалектным глаголом «чубать» — бить, колотить, или с существительным «чубарь» — пёстрый, рябой. Однако основная масса носителей фамилии Чубков (и Чубкова) восходит именно к прозвищу по внешнему признаку. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные модели разбираются как типичные для прозвищ, описывающих внешность.

Географически фамилия Чубкова встречается в разных регионах России, но заметна концентрация на юге и юго-востоке — в бывших казачьих областях (Дон, Кубань), где чуб имел культурное значение как часть образа. Встречается также на Урале и в Сибири, куда фамилию могли занести переселенцы.

Интересная деталь: в некоторых говорах «чубком» называли не только волосы, но и верхнюю часть шапки или пучок перьев у птицы. Поэтому предок мог быть не просто обладателем кудрей, а, например, птицеловом или охотником, носившим шапку с чубом. Но это уже локальные нюансы, которые не отменяют главного: Чубкова — фамилия, прямо указывающая на внешность родоначальника, и в этом её простота и прозрачность.