Фамилия Чубраева образована от прозвища Чубрай. Оно ведет свое начало от украинского нарицательного «чубрiй» - «длинноволосый мужчина», «крестьянин», «деревенщина». Вероятно, прозвище либо содержало указание на особенности внешности основателя фамилии (длинные волосы), либо на род его занятий и социальное положение (крестьянин), либо на черты характера и поведение предка (простоватый), либо на место его жительства (деревня). Согласно другой гипотезе, фамилия Чубраева восходит к топониму Чубра - село в Болгарии, находится в Бургасской области, входит в общину Сунгурларе. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Чубрай, со временем получил фамилию Чубраева.