Фамилия Чубраков — один из тех редких случаев, когда разгадка упирается в диалектное слово, почти исчезнувшее из языка. В основе лежит прозвище Чубрак. В русских говорах, особенно на юге и в Сибири, «чубрак» — это замарашка, чумазый человек, неряха. Человек мог получить такое прозвище из-за неопрятного вида, работы с сажей или землёй, либо, что не менее вероятно, в насмешку над чистюлей (по принципу контраста). Суффикс -ак в таких прозвищах часто придаёт слову оттенок просторечия и экспрессии.

Модель образования стандартна и очень продуктивна: прозвище на -ак (Чубрак) плюс патронимический суффикс -ов, дающий буквальное значение «сын Чубрака». Фамилия относится к типичным русским фамилиям, возникшим в среде крестьян и посадских людей, где прозвища были повседневны.

Интереснее вопрос происхождения самого корня «чубр-». Слово «чубрак» почти наверняка связано с «чуб» — прядь волос, хохол. Чубраком могли называть человека с торчащим, непослушным чубом или, в переносном смысле, с «чубом» грязи. Альтернативная, но куда менее убедительная версия возводит фамилию к тюркскому «чубур» (сор, мусор) — это возможно на южных границах расселения русских, но для центральных и северных областей маловероятно. Правдоподобнее славянская внутренняя деривация от «чуб».

Фамилия редкая, географически не привязана к одной области — встречается и в центральных регионах России, и на Урале, что говорит о её прозвищном, а не топонимическом происхождении. Сословно — почти наверняка крестьянская или мещанская, поскольку в дворянской среде фамилии с таким «сниженным» значением практически не фиксировались. Современный носитель фамилии Чубраков может быть уверен, что его предок получил прозвище за яркую, запоминающуюся внешность или привычку, а не за род занятий.