Фамилия Чульчин — одна из тех, что ставит перед исследователем вопрос: откуда пошёл корень? В ней нет типичного для русских фамилий суффикса -ов/-ев, что сразу указывает на иную, более редкую модель образования. Суффикс -ин в фамилии Чульчин говорит о том, что в основе лежит слово, оканчивающееся на -а или -я, либо прозвище, имевшее такую форму. То есть предка могли звать Чульча, Чулька или Чуля, а его потомки стали Чульчиными.

Самая вероятная версия связывает основу «чуль» с тюркскими языками. В ряде тюркских наречий «чул» или «чол» означает «степь», «пустыня» или «глухое место». Отсюда «чульча» — человек, живущий в степи, отдалённой местности, или же выходец из таких краёв. Это могло быть прозвище, данное переселенцу из южных степей, или указание на глухой, малолюдный характер места, где жил человек. Менее убедительна, но возможна версия от диалектного русского слова «чуль» — так в некоторых говорах называли чурбан, обрубок дерева, что могло стать прозвищем для грубоватого или коренастого человека.

Географически фамилия Чульчин встречается редко, но имеет заметную привязку к Сибири и Забайкалью. Это косвенно подтверждает тюркскую версию: в этих краях исторически активно шло смешение русского и тюркского (бурятского, татарского) населения. Фамилия могла возникнуть как русифицированная форма тюркского имени или прозвища, адаптированная под русскую модель на -ин.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Чулин, Чулкин — показывает, что Чульчин стоит особняком. У Чулина и Чулкина более прозрачная русская основа (от имени Чула, от слова «чулок»), тогда как Чульчин тяготеет к иноязычному корню. Это делает фамилию интересным примером того, как в русском ономастиконе сохранились следы межэтнических контактов.