Фамилия Дакенова — женская форма фамилии Дакенов, и её происхождение упирается в несколько версий, ни одна из которых не лежит на поверхности. С точки зрения словообразования, перед нами типичная фамилия с суффиксом -ов/-ев, то есть образованная от имени или прозвища предка, отвечающая на вопрос «чей?» — сын или потомок Дакена.

Самая вероятная основа — тюркское мужское имя Дакен. В казахском, башкирском, татарском и других тюркских языках имя Дакен (или Дакын) могло быть образовано от слов «дақ» (пятно, метка, родинка) или «дақыл» (злак, посев). В первом случае имя давали ребенку с приметной родинкой — такой себе «пятнистый» или «меченый». Во втором — имя могло быть связано с пожеланием плодородия, урожайности, то есть прозвище земледельца или крестьянина. Встречается и вариант, где Дакен — это диалектное сокращение от арабского имени Данияр (обладающий знаниями), но это менее распространённое объяснение.

В русском контексте фамилия Дакенов почти не встречается в исторических метрических книгах центральных губерний. Её география — преимущественно Казахстан, Оренбургская область, юг Урала и Поволжье, где исторически жили тюркские народы. Это значит, что предки носителя фамилии, скорее всего, были из башкирских, татарских или казахских родов, перешедших на русскую модель фамилий после крещения или в ходе административного учёта в XIX веке.

Спорным остаётся вопрос, была ли фамилия изначально русской, адаптированной к тюркскому звучанию. Встречается редкая фамилия Даконов (от слова «дакон» — устар. «дьякон» в южнорусских говорах), но она пишется через «о», и путать её с Дакеновой не стоит. Фонетика «Дакенов» — с чётким «е» — указывает именно на тюркское происхождение.

Таким образом, носительница фамилии Дакенова может с высокой долей уверенности связывать свои корни с кочевыми или оседлыми тюркскими народами, где имя предка звучало как Дакен, а род его занятий был связан либо с земледелием, либо с внешней приметой, ставшей личным именем.