Фамилия Даняева образована от имени Даняй. В основе, скорее всего, лежит мордовский вариант арабского имени Данай — «прославленный». Однако есть и другая, не менее вероятная версия: Даняй мог быть просторечной формой крестильного имени Даниил («мой судья — Бог»). Оба объяснения указывают на личное имя предка, которое закрепилось за его потомками.

Фамилия Даняева — женская форма от Даняев, а мужской вариант Даняев построен по самой распространённой русской модели: к основе на -й добавляется суффикс -ев. Такое окончание типично для фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -й, -ай, -яй (ср. Андреев, Тимофеев, Матвеев). Мордовское происхождение основы — редкая деталь, которая сразу выделяет эту фамилию среди однокоренных: если бы имя Даняй было чисто русским, фамилия скорее всего звучала бы как Даниилов или Данилов. Выбор именно Даняев указывает на региональные или диалектные особенности именования.

Передаваясь из поколения в поколение, фамилия Даняева сохранила память о том, что предка звали просто и уважительно — Даняй. В каком именно сословии возникла фамилия, сказать сложно: мордовские имена в XVI–XVII веках бытовали и среди крестьян, и среди служилых людей. Спор между версиями «арабское имя» и «форма Даниила» неразрешим без конкретных записей, но обе одинаково правдоподобны и не противоречат друг другу — в народной среде заимствованное имя легко переосмыслялось как вариант библейского.