Фамилия Давыденков отталкивается от просторечной формы древнееврейского имени Давид — Давыд. Само имя Давид переводится как «любимый», и именно эта основа, адаптированная русской речью, дала начало целому ряду фамилий. В случае Давыденков мы имеем дело с суффиксом -енков, который типичен для южнорусских и украинских земель. Если в северных и центральных областях предпочитали суффикс -ов (Давыдов), то на юге, в том числе среди казачества, активно использовали патронимический формант -енко, а его русифицированная форма -енков закрепилась при переселении семей в другие регионы или при записи в официальных документах.

Таким образом, Давыденков — это буквально «потомок Давыда», причём в качестве исходного взято не полное церковное имя, а его обиходный вариант Давыд. Такое чередование (Давид — Давыд) встречается во многих русских фамилиях: вспомните Давыдова и Давидова — это однокоренные, но не тождественные по происхождению фамилии. Давыденков же стоит в одном ряду с фамилиями вроде Иваненков (от Иван) или Павленков (от Павел), где суффикс -енков указывает на принадлежность к роду конкретного человека.

Интересно, что в донских и кубанских говорах форма «Давыд» была настолько распространена, что фамилии с этим корнем встречаются там особенно часто. Однако именно вариант Давыденков, с характерным суффиксом, может указывать на то, что предки носителя этой фамилии родом из тех мест, где патронимы на -енко были нормой, а затем по каким-то причинам (служба, переселение) получили русское окончание -ов. Никакой другой, более сложной этимологии у этой фамилии нет: она прозрачна и восходит к личному имени, которое веками носили в крестьянской и казачьей среде.